海南的美食旅游正处在一个探索阶段，其问题首先表现在对什么是美食旅游没有一个明确而清晰的概念。主要表现在政府官员、旅行社从业人员、网络宣传人员对美食旅游理解的不统一上。这有可能是因为当今旅游学术界对美食旅游定义的不清晰，从而造成业界对美食旅游的表述不一致。如果海南能够更好地定义美食旅游及其项目范围，它就能够更好地调动其他旅游组织和机构参与到计划和促销活动当中去。
其次，琼菜美食资源的介绍资料整合度低，很多地方美食都是口头传授，缺乏文字记载，从而使不知名里的游客把琼菜仅仅看做是粤菜的一个地方风味，琼菜的个性被淹没在粤菜的特色中。
最后，已经开展过的美食旅游活动举办过程不成熟，并且伴随着餐饮“宰客”事件负面报道的时常发生，给海南旅游，特别是美食旅行造成了消极的负面影响，对美食节举办地周边的环境也带来了一定程度的破坏。
对发展海南美食旅游的建议
1.完善组织机构
海南美食旅游应该是海南餐饮行业与海南旅游行业结合的产物，目前还处在一个缓慢探索的阶段，因而有必要加快其成长的速度，使其能够彰显强大的生命力。主管海南餐饮行业和海南旅游行业的行政机构分别是海南省的旅游局，城乡的建设厅和海南省住房以及海南省的商务厅，而市场主体分别是旅行社和餐饮企业。由此可以看出完善管理机构，规整业务范围孤立分离状态的必要性。在行政机构上，海南省旅游局可以和海南省商务厅联合成立美食旅游协调委员会，共同负责美食旅游的开发与市场管理。在市场组织方面，应充分发挥旅游企业和餐饮企业的能动性和创造性。即旅游企业在调研的基础上，确定旅游产品的主题，再结合餐饮行业的特点，开发旅游路线，组织市场客源；餐饮企业在协调委员会指导的基础上，根据自身特点，设计美食和文化表现形式的改革和创新。
2.突出研究机构
美食旅游不是旅游和美食的简单相加，而是满足市场出现的需求。美食旅游市场需求具有复杂性、综合性和变化性，所以这就需要对美食旅游市场进行研究，不断推出能满足这个市场的产品，激发和延长美食产品的生命力。海南美食旅游的研究需要组织专门的研究机构来实现，而且该机构至少需要具备研究海南美食产业的基础。目前，从海南省现有的研究机构来看，三亚学院是全省唯一一个同时拥有旅行管理学校和国际酒店管理学校，具备整合政，行，企，校各方优势的教育与研究机构。由旅游管理学院牵头主持的对海南美食旅游路线开发、美食旅游表现形式创新、美食特色编辑整理以及美食市场营销等研究正在有条不紊地进行着，并预计在年形成系统化的研究成果。
3.美食、美景、美文化的结合
与看美景相比，游客对美食的感受通常会比对美景的感受来的更加强烈，因为美景会有类似和重复，但具有地域特征的美食却无法雷同。因此，可以将海南美食和知名游玩景点联系起来，将海南美食店开在景区旁或景区内，形成海南美食一条街。让游客在品味海南当地的食品、体验海南食品美味的同时，又能欣赏到海南独特的热带风光。这样可以使美食旅游的内容变得更加的丰富、游客的满意度更高，而且也可以促进海南旅游景区开发变得更加完善。
4.欢乐节与美食节的结合
每年一届的海南岛旅行节是海南地方性的旅游盛事，在促进海南旅游的发展发挥了重要的作用，也在行业界产生了重要的影响。海南岛旅行节是做宣传推介海南旅行资源，促进它的旅游经济发展、树立海南良好形象的重要窗口和平台，已先后成功举办十四届，成为打造海南旅游国际岛经济升级版的一个重要平台。为进一步提升海南美食旅游的影响，应该充分利用欢乐节这个平台，在海南欢乐节期间高规格展示海南美食旅游，策划系列海南美食旅游活动。
5.重视美食旅游人力资源开发
文化素质普遍低下、烹调基本功不扎实、所受文化专业训练少、对其琼菜了解匮乏等问题是海南目前发展美食旅游所面临的严重问题。因此，加强美食烹饪队伍的建设就显得迫在眉睫。在加强美食烹饪队伍的同时，海南美食旅行的开展还需要借助高校的旅行指导和酒店的管理专业，培养海南美食旅游急需的既懂旅游管理，又懂餐饮管理，并具有开拓精神的现代管理经营人才。
美食旅游在海南拥有广阔的市场开发空间，相信通过适当开发，海南美食会成为海南国际旅行景点中的又一个亮点。